Μετά από την ύπαρξη αλλαγών στον αρχικό προγραμματισμό, η ΕΠΑ/ΟΜΑΕ ανακοινώνει το πρόγραμμα του Πανελλήνιου Πρωταθλήματος Καρτ 2016 στην τελική του μορφή, το οποίο διαμορφώνεται ως εξής:
1 Πίστα Καρτ Kartodromo, Αφίδνες (Κυριακή 20 Μαρτίου 2016)
2 Πίστα Καρτ San Nicolas, Καλαμάτα* (Κυριακή 15 Μαΐου 2016)
3 Πίστα Καρτ Μεγάρων, Μέγαρα* (Κυριακή 11 Σεπτεμβρίου 2016)
4 Πίστα Καρτ Kartodromo, Αφίδνες (Κυριακή 9 Οκτωβρίου 2016)
* Προϋπόθεση πως οι συγκεκριμένες πίστες θα έχουν προβεί στις απαιτούμενες ενέργειες για την διεξαγωγή αγώνων.